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Diez simples reglas…
1Philip E. Bourne, editor jefe de la revista científica “PLOS Computational Biology”:http://compbiol.plosjournals.org/ ha escrito (con la ayuda de unos amigos) unas interesantes guías para todo el que se dedique a la carrera científica.
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La serie se llama “["Diez simples reglas":http://collections.plos.org/ploscompbiol/tensimplerules.php]” (o pautas) y en cada guía nos da los consejos esenciales para ["hacer un buena charla oral":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0030077], ["escribir un buen artículo":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0010057], ["hacer un buen poster":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0030102], ["elegir trabajo postdoctoral":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0020121], ["llevar a cabo una colaboración científica":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0030044], ["conseguir financiación":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0020012] o ["ser un buen revisor":http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pcbi.0020110].
Interesante lectura para todo tipo de científicos, algunos (muchos) que conozco deberían tatuarse algunos de los consejos a fuego (a ser posible en algun sitio donde duela de verdad) o repetirlos como un mantra cada día para ver si se les pega algo…
Freebase, Google Base y el avance científico
0La historia reciente nos ilustra con varios precedentes de como los avances en las tecnologías de la información han hecho dar pasos de gigante a la ciencia.
El primero fue cuando las publicaciones científicas empezaron a “colgarse” en Internet. Del lento y tedioso proceso de mirar catálogos en las bibliotecas y posteriormente pedir copias por correo a los autores, se pasó a poder buscarlos “online”. Los contenidos (al menos los resúmenes de cada artículo) se incluyeron en bases de datos gratuitas, como ["PubMed":http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi], pudiéndose buscar fácil y rápidamente. De horas de infructuosa “arqueología” se ha pasado a un sencilla búsqueda en Internet cuyos resultados pueden programarse en un e-mail periódico o incluso acceder a los cambios a través de RSS. Las ideas principales de cada artículo pueden intercambiarse instantáneamente en vez de llegar con meses o años de retraso.
Después se pudo además ver los artículos completos en formato PDF, con suscripciones, gratuitamente en editoriales sin ánimo de lucro como ["PLOS":http://www.plos.org/] o con iniciativas gubernamentales como ["PubMed Central":http://www.pubmedcentral.nih.gov/]. La biomedicina siguió avanzando espectacularmente cuando los datos de los genomas y proteomas de múltiples organismos empezaron a almacenarse en bases de datos accesibles gratuitamente.
Pero la facilidad de publicación, también tiene sus fallos. La información es cada vez más compleja, millones de imágenes, hojas de cálculo, modelos matemáticos, estructuras tridimensionales y un sinfín de otros datos inclasificables son publicados diariamente como archivos suplementarios que se acaban perdiendo en una complicada red de enlaces que no se pueden buscar de una manera sistemática. A ese nivel el mundo científico sigue ["en la edad de piedra":http://www.nature.com/nature/journal/v438/n7067/full/438400a.html].
¿Soluciones? Una par de iniciativas novedosas intentan integrar cualquier información en bases de datos mundiales, ["Google Base":http://base.google.com/base] y ["Freebase":http://www.freebase.com/signin.html]. Con que los datos puedan ser indexados con palabras clave se dará un salto de gigante.
Children of men
1En un futuro cercano, la raza humana está aquejada de una horrible “epidemia”, infertilidad total, ya no hay niños, no hay futuro, no hay esperanza. Este es el argumento de la estupenda película de Alfonso Cuarón, ["Children of Men":http://www.imdb.com/title/tt0206634/], basada en el libro del mismo título de P.D. James.
¿Ficción?
Un estudio científico publicado hace cuatro años en la revista “Current Biology”:http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VRT-4893N7S-J&_coverDate=04%2F01%2F2003&_alid=526910490&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_qd=1&_cdi=6243&_sort=d&view=c&_acct=C000050221&_version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=5e620d92fc1a51041d35997ad899f5b6 descubrió que el compuesto “bisfenol A”:http://en.wikipedia.org/wiki/Bisphenol_A (Bisphenol A o BPA) producía fallos en la formación de las células reproductoras femeninas de ratón (concretamente en la meiosis de los oocitos en maduración), siendo un factor de riesgo a tener en cuenta dado que el bisfenol A forma parte de múltiples plásticos y envases de uso cotidiano. ¿Miedo? El tema quedó un poco en el aire. Pero un nuevo estudio del mismo grupo que acaba de ser publicado en la revista “PLOS Genetics”:http://genetics.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371%2Fjournal.pgen.0030005 ha demostrado que los efectos dañinos del bisfenol A se pueden “heredar” por lo menos durante dos generaciones, o sea que los fallos en la formación de óvulos siguen ocurriendo en las hijas y en las nietas. Como indica la editorial de la revista ["PLOS Genetics":http://genetics.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pgen.0030006]: “el estudio saca a la luz el alarmante tema de si este compuesto químico u otros de similar estructura suponen un riesgo grave para las capacidades reproductivas de la especie humana”.
Como han declarado los autores de la investigación, estamos expuestos al BPA a diario. Es un componente de los ["plásticos policarbonatos":http://es.wikipedia.org/wiki/Policarbonato], se usa para fabricar envases de bebidas y comidas, y además se usa como aditivo en múltiples productos. Se producen anualmente millones de toneladas de BPA en todo el mundo y varios estudios ya han detectado su presencia en tejidos humanos.
Un problema añadido consiste en ver la trascendencia real de este estudio una vez extrapolado a seres humanos (recordar que la investigación se ha realizado en ratones), ya que la tasa de fallos en la gestación que acaban en aborto es muy elevada en la especie humana (“normalmente” entre el 15 y el 20 %). Más difícil aún si consideramos que la edad media del primer embarazo se ha atrasado mucho en occidente (de 28 a 35 años entre 1975 y 2005), hecho que aumenta considerablemente la frecuencia de problemas durante el embarazo. Pero a pesar de esto y aunque existan muchas dificultades experimentales para confirmar o refutar este estudio en humanos, la pregunta sigue en el aire y crece: ¿Provocan los compuestos químicos como el BPA defectos en la capacidad reproductora humana? Según las compañías que producen el BPA, el compuesto hace ["nuestra vida más saludable y más segura cada día":http://www.bisphenol-a.org/](1), pero si la respuesta a la pregunta se demuestra positiva veo un futuro muy negro para sus acciones.
–(1) Ya mosquea cuando las compañías químicas se dedican a explicarse tan profusamente.–
Tabú
1“["Men, Women, and Ghosts in Science":http://biology.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pbio.0040019]” por Peter A. Lawrence (publicado en ["PLOS Biology":http://biology.plosjournals.org/]). Interesantísimo ensayo científico. Recomiendo su lectura completa. Introducción:
«Some have a dream that, one fine day, there will be equal numbers of men and women in all jobs, including those in scientific research. But I think this dream is Utopian; it assumes that if all doors were opened and all discrimination ended, the different sexes would be professionally indistinguishable. The dream is sustained by a cult of political correctness that ignores the facts of life—and thrives only because the human mind likes to bury experience as it builds beliefs. Here I will argue, as others have many times before, that men and women are born different. Yet even we scientists deny this, allowing us to identify the “best” candidates for jobs and promotions by subjecting men and women to the same tests. But since these tests favour predominantly male characteristics, such as self-confidence and aggression, we choose more men and we discourage women. Science would be better served if we gave more opportunity and power to the gentle, the reflective, and the creative individuals of both sexes. And if we did, more women would be selected, more would choose to stay in science, and more would get to the top.»
Verdades como puños
2La patética e inmutable situación de la investigación científica en España ha sido retratada con total acierto en este magnífico artículo de Tomás Ortín Miguel (["El País":http://www.elpais.es/articulo/elpedupor/20060206elpepiedu_8/Tes/Mejores%20universidades%20para%20Espa%F1a]). Imprescindible leerlo completo. Fragmento:
«¿Cómo podríamos poner alguna universidad de España entre las mejores del mundo? Para hallar la respuesta (simple pero dura de poner en práctica), basta fijarse en qué hacen las mejores universidades del mundo para serlo.
Fijémonos, pues, en qué tienen en común Princeton, Berkeley, Stanford o Cambridge, unas públicas y otras privadas (pero todas muy subvencionadas de diferentes formas por el estado, y prácticamente todas del mundo anglosajón). Salta a la vista que en las mejores universidades trabajan los mejores investigadores y que básicamente es esto lo que las convierte en las mejores. Además, la presencia de los mejores investigadores en las mejores universidades es el resultado de la voluntad de serlo, traducida en un esfuerzo continuado para atraer buenos investigadores, compitiendo por ellos; un esfuerzo por seleccionar y retener a los mejores (sin preocuparse de su origen, sin pedirles homologaciones ni convalidaciones) ofreciéndoles buenas condiciones de vida y de trabajo, los medios y apoyo para desarrollar su potencial y que su tiempo no se pierda en inútiles burocracias. La excelencia de la formación que proporcionan estas universidades está automáticamente garantizada por la calidad científica de los profesores, a quienes no se les exige que sepan un temario concreto (una exigencia absurda en una era en que el conocimiento avanza muy deprisa) sino, simplemente, ser líderes en su campo. Los resultados confirman plenamente esta política y, allí donde los estudiantes pueden elegir universidad libremente y con información, escogen universidades que siguen estas pautas generales.
La lista de aciertos de las mejores universidades es la lista de los errores de las nuestras. Para empezar (hace falta decirlo), con honrosas excepciones, los mejores investigadores están en las mejores universidades, no en las nuestras. No hay voluntad de estar entre las mejores, y, por lo tanto, no hay un esfuerzo continuado para atraer a buenos investigadores y seleccionar y retener a los mejores. Las trabas administrativas no permiten competir por contratarlos: se les exigiría la homologación del título (un trámite mucho más lento que la naturalización de un futbolista extranjero) aunque fuesen premios Nobel, y no se les podría ofrecer nada más que su propio puesto de trabajo con el salario de un profesor universitario principiante. Es evidente que estas trabas habrían desaparecido hace mucho si las universidades hubiesen estado interesadas en contratar a los mejores investigadores que, en muchos casos, son extranjeros. Otro tanto puede decirse del CSIC, pero no de su homólogo catalán, el ICREA, que está logrando atraer a buenos científicos del extranjero, de otras universidades españolas y del CSIC, que, correspondientemente, los pierde.
Siendo el secreto de las mejores universidades tan sencillo, habría que preguntarse por qué nuestras universidades no hacen lo mismo. Claro que, ¿qué podría impulsar a las universidades españolas a competir por ser las mejores, si su financiación y la afluencia de alumnos (sin información y con poca capacidad de elección) están aseguradas independientemente de los resultados (que, por otro lado, no se evalúan)? Faltan palos y zanahorias en el sistema, que permite, no sólo que no se seleccione a los mejores del mundo, sino que ni tan siquiera se seleccione a los mejores del mercado español.
(…)
No basta con entender el problema y sus causas: hay que actuar urgentemente. No podemos permitirnos perder esta oportunidad y provocar una nueva fuga, o más bien despilfarro, de cerebros, dinero invertido y prestigio ganado porque este programa se ha convertido en un callejón sin salida. Hay que reformar pronto la carrera investigadora. Aunque, al final, cualquier sistema es corruptible y sólo una buena dosis de palos y zanahorias basada en evaluaciones por comités internacionales con resultados públicos y libre elección de universidad de los estudiantes apoyada con becas, consiga que las universidades se esfuercen en seleccionar a los mejores de forma autónoma (como la Constitución impone) sin necesidad de la tutela estatal.
Hay que lograr que sean los mejores los que investiguen aquí y enseñen a nuestros hijos. Cada profesor-investigador mal escogido despilfarrará el dinero público 35 años e influirá negativamente sobre 35 promociones de alumnos, y ni estos ni nuestra sociedad se lo merecen. Nos merecemos algo mejor: mejores universidades.»
La importancia del acceso libre
0Que la ciencia de calidad con acceso libre tanto para su lectura como para su difusión es uno de los grandes logros de la evolución de Internet, puede demostrarse con una sola imagen.

Disponible “libre” y “gratuito” en ["PLOS Biology":http://biology.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pbio.0030380].
Enfermedades Olvidadas
0Interesante artículo en “PLOS Medicine”:http://medicine.plosjournals.org/ sobre esas “enfermades olvidadas”:http://medicine.plosjournals.org/archive/1549-1676/2/11/equation/10.1371_journal.pmed.0020336.e001.gif que azotan el tercer mundo y que con una mínima intervención podrían reducirse o desaparecer.
“["Rapid-Impact Interventions: How a Policy of Integrated Control for Africa's Neglected Tropical Diseases Could Benefit the Poor":http://medicine.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pmed.0020336].”
There are many people in Africa who do not have HIV or TB and have survived malaria, but are nonetheless permanently polyparasitized by debilitating, disabling, and sometimes fatal conditions, which can be treated at a cost of US$0.40 per person annually. Controlling Africa’s neglected diseases is one of the more convincing ways to “make poverty history” through affordable, pro-poor, effective, and tested strategies.
Ver:
“Ciencia de acceso libre”:http://www.junjan.org/weblog/archives/2004/05/30/ciencia_de_acceso_libre.html
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